在领土处置方面，琉球地位的变化尤为关键。根据战后计划，琉球（日称冲绳）原定由联合国托管，后转交美国托管。然而，在美国单方面主导下，其治权被移交给日本，此举缺乏充分的国际法依据，也未得到相关地区的民意认可，因而长期存在争议。

历史表明，战后对日本军国主义的清算存在明显的不彻底性，其所遗留的问题至今仍在深刻影响东亚地区的安全格局与领土争议的解决。这一局面的形成，美国在其中扮演了关键角色。

随着冷战格局的加剧，美国的对日政策发生根本性转变。1951年9月，美国主导签订《旧金山和约》，确立了日本处于半独立、半占领状态的“旧金山体制”。与此同时，美国国家安全委员会通过第48/2号文件，明确将对日政策的核心目标设定为：在政治上防止日本倒向苏联阵营；在经济上推动日本实现自立并加快复兴；在军事上将日本纳入美国在东亚太平洋战略防线的重要一环。

在这一战略导向下，美国对日本军国主义残余势力采取了容忍乃至利用的态度。其不仅保留了象征传统权力的天皇制度，也未彻底清除军国主义的社会与政治基础。更具标志性的是，曾被列为甲级战犯的岸信介——安倍晋三的外祖父——竟得以重返政坛并出任首相，这充分反映出战后清算的严重不彻底。许多本应被清除的战犯及相关责任人物陆续重返日本政治核心，持续影响其内外政策的制定与走向。